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Win10系统下安装MS,最后安装证书时一直出现图片中问题,该怎么处理呢
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想要用BKS力场对二氧化硅晶体进行模拟退火处理,得到无定形的二氧化硅结构,但是由于涉及到高温,所以要在BKS中加入修正项,看文献中有的是加了一个D/r^12项,但是在lammps里貌似没有这种函数形式,我知道pairtable可以解决,但是不知道这种pairt...
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本人现在博一,刚刚开始接触在Linux系统中运行LAMMPS软件,有一个问题想请教各位前辈,希望不吝赐教。1)如何在Linux环境中完整地运行一个LAMMPSscript,从而得到预期的结果,麻烦把详细的步骤写出来。谢谢。我的QQ是1157550269,微信是...
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想利用ms模拟扩散系数,建好模型后能量最小化就出错了,在线等,急
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老师,请问如何运用autodock删除蛋白中钾离子smutao
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虚心请教,1:那款软件可以计算双相溶剂,以及2:如何更好的描述双相溶剂(例如,水和任何一种不相溶的有机溶剂,如CH2Cl2)与溶质分子之间的相互作用!我知道Gromacs这款软件可以模拟双相体系,由于我不对分子动力软件并不太了解,对里面的原理不清楚,所以不敢随...
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大家好!最近在用MaterialsStudio做一些关于气体在不同介质中的吸附和MD的运算。由于刚开始接手,现在没有什么头绪。想要问问大家是如何找到各个晶体的结构的。利用MS自己建立模型吗?我看到有人说95%以上的晶体结构是可以通过CCDC、COD等数据库得到...
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GROMACSAMBERLAMMPS第一性原理VASP资料整理中需要的留下邮箱表明需要什么学习的话也可以加我QQ1424808077
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想选择一个聚合物分子链中所有的叔氢,试过forcefieldtype把所有的氢原子都选了实现不了求助大神们有没有一种方法可以实现实在不行就得手选了T.T
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我现在老师让我换个方向,用分子模拟的方法计算动力学,想请问下大家ms中的dmol3模块和高斯模块是不是不适合液相反应的模拟啊?大家还有没有其他适合的软件推荐啊?
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看别人写的输入文件,在定义变量时,有的用了$这个符号,有的没用360截图16730305479753.png
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语句中最后的数字“100”,怎么理解初始温度是100K,终止温度是1K,那最后一个数字呢我大概知道它是指阻尼系数。但是我想知道的是:温度从100K是按照一个怎样的规律变成...
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请问我在MS中建立了双层石墨烯模型后,石墨烯间的键是直接就有力场还是我要自己设置?两层石墨烯之间的力场我应该怎么加呢?
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“LAMMPS分子动力学模拟技术与应用”培训课程(简略大纲)第一天上午LAMMPS基础分子模拟理论第一天下午LAMMPSS入门操作的Linux基础命令第二天上午LAMMPS建模计算实例操作:环氧树脂材料在二氧化硅表面吸附过程模拟第二天下午LAMMPS数据分析第...
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求charmm力场怎么做不同长和宽的膜?谢谢
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问下各位大佬关于复合材料的事情。问题如下1、可以只用lammps来构建复合材料的模型吗?2、如果说能构建的话我该去哪些地方找相关的材料?如果不能构建那么我还需要去了解哪个软件?构建什么模型呢?
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生成的date文件如下Runningmsi2lmpv3.9.8/06Oct2016Forcefield:ClassIForcefieldfilename:../frc_files/cvff.frcOutputisrecenteredaroundgeometri...
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我做的是金属体系,我用的是LJ势函数,那么我在设置单位的时候,units应该设置为metal呢还是lj呢?
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我的car、mdf、cvff文件都放好了Runningmsi2lmpv3.9.8/06Oct2016Forcefield:ClassIForcefieldfilename:D:\\LAMMPS64-bit29Jun2018\\frc_files;D:\\LAM...
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问以前做分子动力学的大牛要的课件里面有些案例和其他立场,有需要的可以加我微信或者qqv15311528380qq250067232备注万博体育manbetx自己的软件
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现在老师让做一个模型,怎么都做不好原来做的就是按师姐的步骤来的,包括各种参数都是一样的;现在自己来反而做不了大家都是怎么决定自己的操作步骤的呢,是参考文献,还是按前人的方法,还是受过培训、自己懂些原理自己设定参数的呢
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schrodinger2018-1软件是CADD中的老大,功能不用说了,发个种子,大家来加速!
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各位虫友好。氧化物熔体模拟中,多面体连接的快照可以用vmd做到吗?文献中只说用lammps计算,并没有说采用哪个软件显示的。1.png
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假设我有一根固定住的碳纳米管,我初始温度为0K,达到稳定后,记为状态1,然后我升温到2000K,达到稳定后,记为状态2.我想问一下,如果我再回到0K,此时碳纳米管的状态是同状态1,一样吗,还是新的状态3。
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运行dynamics,限制了部分粒子,没法用npt,不理解;想在限制部分的情况下用npt,有办法解决吗;急求
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请问一下,在这条命令中,5.741表示什么pair_stylehybrideammorse5.741tersoff
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如题,MS6.0里面两个原子之间的键长距离如何实现精确控制?我用Alt+shift+鼠标右键实现了原子之间的移动,但是其距离不知道如何做到精确控制,每次离我的目标距离不是大就是小,看到别人的帖子说键长距离可以调,但是我的键长双击后为只读模式,不可修改.请教各位...
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我想用EMD算二氧化碳的热导率,力场用的刚性TraPPE力场,用fixrigid命令对它就行刚性约束,然后算出来的热导率比正常的大好几个数量级;相同的in文件,只是把rigid刚性约束去了,把键的力常数设为一个比较大的数,这个时候就相对正常了,各位有遇到这种情...
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lammps中neighborlist值与Morse势函数中的cutoff值有什么联系吗?
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小白一只,测试结果如图,我试了几个命令,有不能使用的。
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